Сучасні можливості ПЛР діагностики COVID-19 в лабораторії ДІЛА дозволяють відповісти на кілька дійсно важливих питань:
- Наявні чи відсутні вірусні частинки в досліджуваному матеріалі шляхом виявлення РНК вірусу;
- визначити вірусне навантаження (ВН) - яка кількість вірусів знаходиться в 1 мл біоматеріалу (у зіскребку із слизових носо-і ротоглотки).
Від показника ВН (високе, середнє, низьке) безпосередньо залежить заразність інфікованої людини для оточуючих.
Найінтенсивніше вірус розмножується за 1-3 дні до появи симптомів і в перші 5-7 днів після перших проявів. У цей період кількість вірусів в 1 мл виділень з носоглотки може становити сотні тисяч і мільйони частинок, що відповідає середньому і високому показнику вірусного навантаження та робить пацієнта максимально заразним для оточуючих. Потім кількість вірусів, що виділяються людиною починає знижуватися. Зазвичай, починаючи з 7-10 дня від початку клінічних проявів людина перестає бути заразною, що відповідає зниженню показників вірусного навантаження. У цей період вірусна РНК в аналізі ще може виявлятися (ПЛР позитивний з низьким рівнем ВН), однак більшість досліджень показує, що після 10 дня клінічних проявів вірус втрачає свою здатність до реплікації (розмноження), а значить, і здатність заражати інших людей.
Як визначається ВН і що означає показник Сt*
Для умовного визначення ВН використовують показник «пороговий цикл», позначений в результаті аналізу як Сt (Сycle threshold). Він показує, яка кількість циклів ампліфікації відбулася до того моменту, як кількість РНК в зразку збільшилася настільки, що стала доступною для того, щоб прилад зміг її «побачити». Іншими словами, Сt - це і є той пороговий цикл, на якому виявлений вірус. Відповідно, чим більше вірусних частинок в зразку, тим швидше їх виявить тест-система. З кожним циклом кількість копій подвоюється, а ПЛР в реальному часі, як правило, відбувається протягом 40 циклів. Після кожного циклу оцінюють наявність світіння (флюоресценції), що випромінюють мітки на певних ділянках РНК збудника. Чим раніше і інтенсивніше почалося світіння (наприклад, на Сt = 5), тим більше вірусів знаходиться в біологічному матеріалі.
* Число Ct - умовний показник визначення вірусного навантаження
Як розуміти отриманий результат дослідження
Якщо значення Ct низьке (5-15), це свідчить про те, що вірусне навантаження високе і вірус SARS COV-2 передає свою генетичну інформацію та розмножується дуже активно, утворюючи нові вірусні РНК у великій кількості і тим людина є більш заразною.
Якщо вірусних частинок мало, для їх виявлення потрібна більша кількість циклів. Чим вище значення порогового циклу (Ct = 30-35-40), тим менше вірусних частинок знаходиться в зразку.
Результат ПЛР негативний в тому випадку, якщо РНК вірусу виявити не вдається навіть при найвищому пороговому циклі чутливості приладу - більше 40 циклів ампліфікації (Сt більше 40: РНК SARS COV-2 не виявлено).
| Результат | За наявності симптомів | За відсутності симптомів |
| Сt 5-27. Високе ВН |
Людина хвора COVID-19, високо заразна для оточуючих.
Рекомендується:
|
Людина заражена COVID-19, високо заразна для оточуючих. Рекомендується:
|
| Сt 28-34. Середнє ВН |
Людина хвора COVID-19, є ризик зараження оточуючих. Рекомендується:
|
Людина заражена COVID-19, є ризик зараження оточуючих. Рекомендується:
|
| Ct 35-40. Низьке ВН |
Людина хвора COVID-19, ризик зараження оточуючих зберігається, але він ймовірно низький. Можливо початок захворювання. Рекомендується:
|
Людина заражена COVID-19. Найчастіше це може бути в період одужання (виведення вірусу). Рекомендується (якщо був контакт з хворим на COVID-19):
|
| ПЛР негативна |
Ризик зараження оточуючих відсутній. Можливо:
Для уточнення діагнозу рекомендується:
|
Ризик зараження оточуючих відсутній.
Тест на імуноглобуліни класу G допоможе уточнити, чи перехворіли ви на коронавірусну інфекцію раніше. |
При виявленні будь-якого з досліджуваних генів коронавірусу результат тесту є позитивним, що означає присутність вірусу в організмі.
Важливо пам'ятати, що клінічні прояви захворювання можуть бути відсутні при будь-якому рівні вірусного навантаження. При позитивному результаті ПЛР з високим рівнем вірусного навантаження і відсутності симптомів захворювання (безсимптомному перебігу) ви високо заразні для оточуючих, оскільки з носоглотки виділяється багато вірусів при диханні, розмові. Для контролю зменшення заразності можна провести повторне ПЛР-тестування з визначенням рівня вірусного навантаження через 7-10 днів.
