Панель для гастроінтестинальних стромальних пухлин (GIST: мутації KIT та PDGFRα), ПЛР

Патоморфологічна та онкологічна панель

Панель GIST передбачає молекулярно-генетичне дослідження соматичних мутацій у генах, що кодують рецепторні тирозинкінази: KIT (рецептор фактора стовбурових клітин) та PDGFRA (рецептор альфа-фактора росту тромбоцитів).

Дослідження проводиться методом ПЛР в режимі реального часу (специфічним аналізом фрагментів), що дозволяє виявити делеції, інсерції та точкові мутації визначених генів:

• ген KIT: аналіз екзонів 9, 11, 13 та 17;
• ген PDGFRα: аналіз екзону 18 (мутація D842V).

Досліджувані генетичні зміни гена KIT:
Y503_F504insAY - екзон 9;
р.V559D, р.V559G, р.V560D, р.W557R - екзон 11;
W557_E561del, W557_K558del, W557_V559>C, W557_V559>F – екзон 11;
V559A, W557G - екзон 11;
D816H, D816V - екзон 17;
K642E - exon 13;
K818R, N822H, N822Y - екзон 17;
D820G, D820Y, N822K - екзон 17;
L576P - екзон 11.

Досліджувані генетичні зміни гена PDGFRа:
D842V - екзон 18.

Близько 85–90% GIST мають мутації в одному з цих двох генів, які є взаємовиключними та призводять до конститутивної (постійної) активації кіназної активності, що стимулює неконтрольований поділ клітин.

Важливо! Для забезпечення достовірності результату ПЛР-дослідження, слід використовувати гістологічно верифікований матеріал того ж зразка, що застосовувався для первинного дослідження.

Молекулярно-генетичне профілювання є обов’язковим етапом діагностики згідно з протоколами ESMO та NCCN для всіх пацієнтів із верифікованим GIST.

Основні показання:

• підтвердження діагнозу: у складних випадках (наприклад, при CD117-негативних пухлинах) для диференціальної діагностики з іншими мезенхімальними пухлинами;
• планування ад’ювантної терапії: оцінка доцільності призначення тергетної терапії після радикальної операції у пацієнтів із середнім та високим ризиком рецидиву;
• вибір першої лінії терапії: при метастатичних або нерезектабельних формах захворювання;
• оцінка вторинної резистентності: аналіз мутацій при прогресуванні хвороби на тлі поточної терапії інгібіторами тирозинкіназ.

Дозволяє виявити наявність або відсутність специфічних мутацій у генах KIT та PDGFRα й оцінити ймовірність ефективності таргетної терапії інгібіторами тирозинкіназ. Результат використовується для виявлення пацієнтів, які можуть отримати найбільшу користь від специфічного лікування, та допомагає уникнути призначення неефективних препаратів.

Додатково враховується при прогнозуванні перебігу захворювання (оцінка ризику рецидиву після хірургічного втручання) та виборі між різними схемами системної терапії. Тестування є одним із обов'язкових критеріїв для призначення персоналізованої терапії та прийняття рішення про тактику лікування згідно з чинними міжнародними медичними стандартами (NCCN, ESMO), що дозволяє забезпечити максимальну виживаність пацієнтів із гастроінтестинальними стромальними пухлинами.

Клінічний діагноз:

Номер блоку, обраного для дослідження:

Кількість пухлинних клітин:

Відсоток пухлинних клітин:

Мутації гена KIT: V559D, V559G, V560D, W557R - екзон 11

Метод: Полімеразна ланцюгова реакція в реальному часі

Мутація гена PDGFRA D842V - екзон 18

Метод: Полімеразна ланцюгова реакція в реальному часі

Мутації гена KIT: D816H, D816V - екзон 17

Метод: Полімеразна ланцюгова реакція в реальному часі

Мутація гена KIT: Y503_F504insAY - екзон 9

Мутація гена KIT: L576P - екзон 11

Метод: Полімеразна ланцюгова реакція в реальному часі

Мутація гена KIT: K642E - екзон 13

Метод: Полімеразна ланцюгова реакція в реальному часі

Мутації гена KIT: W557_E561del, W557_K558del, W557_V559>C, W557_V559>F - екзон 11

Метод: Полімеразна ланцюгова реакція в реальному часі

Мутації гена KIT: K818R, N822H, N822Y - екзон 17

Метод: Полімеразна ланцюгова реакція в реальному часі

Мутації гена KIT: V559A, W557G - екзон 11

Метод: Полімеразна ланцюгова реакція в реальному часі

Мутації гена KIT: D820G, D820Y, N822K - екзон 17

Метод: Полімеразна ланцюгова реакція в реальному часі

ЗАКЛЮЧЕННЯ: