ДІЛА внедрила тестирование на «Омикрон»

Тесты на штамм коронавируса, который в мире уже окрестили как наиболее заразный доступны в Украине, благодаря оперативному внедрению новых тестовых возможностей в ДІЛА. Теперь выявить штамм Sars-Cov-2 «Омикрон» можно с помощью исследования Коронавирус (SARS-Cov-2), COVID-19, РНК RT-ПЦР-качественный, мутации (ПЦР мутации) с получением заключения об обнаруженных мутациях.

Полученные данные позволяют врачу выбрать правильную тактику лечения, применить алгоритм обследований в опасные периоды заболевания и подобрать максимально эффективную стратегию лечения для каждого пациента.

Исследование ПЦР мутации позволяет:

• выявить генетический материал коронавируса в БМ от 500 копий/мл;
• получить заключение об обнаруженной мутации с указанием штамма коронавируса;
• определить относительную вирусную нагрузку, указывающую на степень заразности ПЦ;
• получить бесплатный перевод на английский язык
   

Эффективность тестов

Хорошо известные в мире ПЦР-тесты, уже продемонстрировавшие свою эффективность, продолжают применять для выявления инфекции, в том числе и «Омикрон». Также, продолжаются исследования для определения влияния на другие типы тестов, включая быстрые тесты на выявление антигена.

ДІЛА использует ПЦР тест-системы с, по меньшей мере, двумя целевыми зонами, которые отсутствуют в перечне «мутированных», что делает невозможным получение «ложноотрицательного» результата, так как тест системы расположены в генах E, N, RdRp, а подавляющее большинство мутаций, свойственных «Омикрону» (B.1.1.529), локализуются в гене S.

Также в ДІЛА используются антиген быстрые тесты, которые определяют нуклеокапсидный (высококонсервативный) ген Sars-Cov-2, поэтому обнаружить удается даже мутированные штаммы коронавируса при средней и высокой вирусной нагрузке.

Что известно о новой мутации

По предварительным выводам ученых, штамм коронавируса «Омикрон» распространяется не просто быстрее дельта-варианта, а со скоростью, которой еще не видели ни в одном предыдущем варианте. Случаи заражения новым штаммом подтверждены в 77 странах и реальность такова, что «Омикрон», вероятно, есть в большинстве стран, даже если он еще не был обнаружен. Об этом сообщает ВОЗ. Ученые предостерегают, что «Омикрон» будет доминирующим штаммом уже в январе следующего года.

Обнаружение Омикрона

24 ноября 2021 ВОЗ сообщили о новом варианте SARS-CoV-2, B.1.1.529. Этот новый вариант впервые был обнаружен в образцах, собранных 11 ноября 2021 в Ботсване и 14 ноября 2021 в Южной Африке.

26 ноября 2021 года ВОЗ определила штамм SARS-CoV-2 B.1.1.529 как вызывающий беспокойство. Это решение было принято на основе рекомендаций Технической консультативной группы по изучению эволюции вируса SARS-CoV-2.

Следовательно, штамм B.1.1.529 «Омикрон» стал пятым штаммом SARS-CoV-2, вызывающим беспокойство. Ранее в этот список входили четыре следующие:

• B.1.1.7 – «Альфа», впервые обнаруженный в Великобритании;
• B.1.351 – «Бета», впервые обнаруженный в Южно-Африканской Республике;
• P.1 – «Гамма», впервые обнаруженный в Бразилии;
• B.1.617 – «Дельта», впервые обнаруженный в Индии.
   

После обнаружения варианта B.1.1.529 в Южно-Африканской Республике эпидемиологическая ситуация в стране характеризовалась тремя отдельными пиками заболеваемости, последний из которых был обусловлен преимущественно штаммом «Дельта». За последние недели наблюдалась резкая вспышка инфицирований, которая совпала с обнаружением нового варианта B.1.1.529. Первый подтвержденный случай инфицирования этим штаммом был зарегистрирован по итогам секвенирования пробы биоматериала, отобранной 9 ноября 2021 года.

18 декабря Министр здравоохранения – Виктор Ляшко сообщил о первом случае заражения «Омикроном» в Украине. Инфицированный пациент вернулся из Объединенных Арабских Эмиратов, где имел контакт с больным Covid-19.

Чем опасен «Омикрон»?

Штамм B.1.1.529 «Омикрон» является очень дивергентным вариантом с пятьюдесятью мутациями, которые могут повысить его передаваемость и обеспечить определенную степень «иммунного бегства». Предварительные данные указывают на связанный с настоящим вариантом повышенный риск повторного инфицирования по сравнению с другими вариантами.

Уже известно о зарегистрированном и описанном случае смерти от «Омикрона», однако в описании отсутствует детализация по статусу вакцинации, а данных для полноценной оценки этого параметра мало, но уже сам факт вызывает обеспокоенность.

«Невидимая» версия «Омикрона»

Британские ученые информируют о «невидимой» версии «Омикрона», которая имеет много общих мутаций со стандартной версией, однако в ней отсутствует та часть генетических мутаций, позволяющая использовать обычные ПЦР системы для обнаружения заражения. Невидимую версию «Омикрона» удалось идентифицировать среди образцов геномов коронавируса, предоставленных Южной Африкой, Австралией и Канадой, однако вполне вероятно, что его распространенность значительно шире. Эти особенности «Омикрона» заставили разделить его на 2 разные линии:

1. Стандартный вариант "Омикрона" BA.1.
2. Новый вариант BA.2.

«Невидимая» версия существенно отличается генетически, следовательно и ведет себя иначе, и идентифицируется труднее.

Тест системы, которые рутинно используют в Британии и многих других странах мира, и составляют около половины всех тестов в стране, ищут три гена в вирусе, однако тесты на «Омикрон» показывают «положительный» результат только в ответ на два из них, что обусловлено мутациями в гене «S».

Течение заболевания

Пока не ясно, вызывает ли инфекция «Омикрон» более тяжелое заболевание по сравнению с инфекциями и другими вариантами, включая «Дельту». Предварительные данные свидетельствуют о росте количества госпитализаций в Южной Африке, но это может быть связано с увеличением общего количества инфицированных людей, а не из-за специфического заражения «Омикрон». Отличительной чертой нового штамма является миалгия, то есть мышечная боль, однако эксперты в области здравоохранения пока не могут объяснить его причины.

Первоначальные сообщения об инфицировании были среди студентов университетов — молодых людей, которые, как правило, имеют более легкие формы заболевания, но понимание уровня тяжести варианта «Омикрон» займет от нескольких дней до нескольких недель. Все варианты COVID-19, включая вариант «Дельта», который является доминирующим во всем мире, могут вызвать тяжелое заболевание или смерть, в частности у наиболее уязвимых людей, и поэтому профилактика всегда является ключевой.

Предварительные данные свидетельствуют о том, что может быть повышен риск повторного заражения «Омикроном» (т.е. люди, ранее болевшие COVID-19, могут легче повторно заразиться «Омикроном»), по сравнению с другими вариантами, вызывающими беспокойство, но информация ограничена.

Эффективность вакцин

ВОЗ сотрудничает с техническими партнерами, чтобы понять потенциальное влияние этого варианта на существующие контрмеры, включая вакцины. Сегодня уже известно, что из-за большего количества мутаций в частности в гене S «Омикрон» более устойчив к ранее разработанным вакцинам, но вызывает менее тяжелое течение. Поэтому применение вакцин остается решающим для уменьшения тяжести заболевания и смертности, в том числе против доминантного циркулирующего варианта «Дельта». Современные вакцины остаются эффективными против тяжелых заболеваний и смерти.

Эффективность современных методов лечения

Кортикостероиды и блокаторы рецепторов IL6 останутся эффективными для лечения пациентов с тяжелым течением COVID-19. Также проводится работа по оценке других методов лечения, и выясняется насколько они эффективны в связи с изменениями частей вируса в варианте «Омикрон».

Диагностика «Омикрона»

ПЦР тест-системы, используемые в ДІЛА, определяют коронавирус по целевым высококонсервативным и высокоспецифическим генам: E, N, ORF1ab, RdRp, тогда как подавляющее большинство мутаций, присущих штамму «Омикрон» (B.1.1.529) локализованы в гене S. Благодаря этому, удается обнаружить даже мутированный штамм, делая невозможным получение «ложноотрицательного» результата.

Для ПЦР исследования ДІЛА использует запатентованную европейскую технологию Fast Trask DiagnosticsTM, которая гарантированно обеспечивает достоверные результаты уже через 8 часов и рекомендована главными разрешительными органами США и Европы, поскольку не требует перепостановки теста. Тестовая система определяет таргетные гены коронавируса Sars-Cov-2: высокоспецифические и высококонсервативные ORF1ab и N, поэтому, когда пациент получает положительный результат RT-ПЦР - делать дополнительный тест для подтверждения нет необходимости.

В ДІЛА также доступна диагностика «Омикрона» методами: «ПЦР качественный» и «ПЦР мутации», которые выявляют новый штамм вируса без предоставления вывода о мутации.